Setiap hari senin pagi, SMPN 16 Bekasi selalu menyelenggarakan kegiatan apel pagi. Kegiatan Apel pagi dipimpin oleh ibu kepala sekolah. kegiatan apel dilaksanakan agar seluruh guru dan tata usaha bisa mendengar arahan berkaitan bekerja selama masa pandemi langsung dari Kepala sekolah.